Средняя общеобразовательная школа № 9 – одна из старейших школ города Нижнеудинска.
С построением Транссибирской железнодорожной магистрали началось освоение и развитие Сибири. 9 сентября 1897 в Нижнеудинск пришел первый железнодорожный поезд. Для обслуживания железной дороги требовались грамотные специалисты, поэтому в 1899 в одном из привокзальных зданий барачного типа было открыто реальное училище по их подготовке.
В 1900 на месте реального училища начала функционировать одноклассное начальное училище, в котором в основном обучались дети железнодорожников. Начальная школа позднее (в 1906) стала двухклассной, имела 5 отделений и по уровню знаний соответствовала пяти классам современной средней школы. Руководил школой Владимир Андреевич Плотников.
В первые годы Советской власти (1918–1923) школа стала семилеткой, в то время в ней обучалось около 200 учащихся, и называлась она ФЗС-2 (фабрично-заводская семилетка). При школе был открыт интернат для 82 детей, приезжавших учиться с железнодорожных разъездов, полустанков и блок-постов. Возглавляла школу в тот период Лидия Васильевна Паули.
В 1923–1924 учебном году в школе был открыт 8-й класс, в который пришли учиться 16 человек. В 1930 восьмилетка приобрела статус средней школы, поэтому выпускники восьмого класса получали Свидетельство об окончании средней школы.
Школа стала десятилетней в 1937. Руководила школой Анна Васильевна Требуховская, затем – Мария Матвеевна Белавенцева. В 1940 для школы было построено двухэтажное каменное здание, однако дети проучились в нем только год. С началом Великой Отечественной войны и по 1945 в новом здании школы располагался военный госпиталь.
В 1960–1961 учебном году школа перешла на 11-летнее обучение и называлась «Средняя общеобразовательная трудовая политехническая школа с производственным обучением». Юноши с 9 класса приобретали специальность слесарей по ремонту электровозов. Базой для прохождения производственной практики было локомотивное депо станции Нижнеудинск. Девушки получали специальность воспитателей детских садов. Практику проходили в ведомственных детских садах, подчиненных Отделу образования ВСЖД. Надежды государства на то, что средние школы будут выпускать специалистов, не оправдались, и в 1967 школа вернулась к десятилетнему обучению. В этот период школу возглавлял Иван Александрович Шарыпов (с 1966 по 1971).
В 1975 в школе был открыт музей имени Д.М. Карбышева. Собирать материал о Карбышеве ученики начали еще в 1964. Они вели активную переписку с музеями, родственниками, соратниками. В это же время появился и музей боевой и трудовой славы.
В 1984, когда учебное заведение возглавлял Павел Иосифович Давыденко, был сдан в эксплуатацию пристрой к школе.
Почти 100 лет школа находилась в ведении Министерства путей сообщения и называлась «Средняя школа № 9 станции Нижнеудинск ВСЖД».
В декабре 1993 школа была передана городскому отделу народного образования и получила название «Муниципальная общеобразовательная средняя школа № 9 города Нижнеудинска».
В 1997 школа была зарегистрирована как Муниципальное общеобразовательное учреждение средняя общеобразовательная школа № 9.
С 01 января 2006 в связи со сменой учредителя она переименована в Муниципальное общеобразовательное учреждение среднюю общеобразовательную школу № 9 Администрации муниципального района муниципального образования «Нижнеудинский район».
Постановлением Администрации муниципального района муниципального образования «Нижнеудинский район» от 30.11.2010 № 920 «Об изменении типа бюджетных учреждений» школа стала именоваться Муниципальным казенным учреждением «Средняя общеобразовательная школа № 9 г. Нижнеудинск».
